هنگامی که یک نبرد انفجاری با دکتر اگمن جهان را در هم می شکند، سونیک در ابعاد موازی مسابقه می دهد تا دوباره با دوستان خود ارتباط برقرار کند و جهان را نجات دهد.
اگر یک قهرمان از خود گذشته فداکاری بزرگی نکند، واقعیت متوقف می شود. اما آیا این برای جبران خسارتی که ناین به جهان زده کافی است؟
سونیک متوجه یک توانایی می شود که ممکن است با آن بتواند ناین را شکست دهد. اما ارتش بی پایان ناین فقط یک هدف دارد: انرژی سونیک را محصور کند.
سونیک برای شکست دادن بزرگ ترین ربات میدان نبرد و نزدیک تر شدن به ناین باید سریع عمل کند و اجازه دهد دوستانش هم کمی کمکش کنند.
سونیک باید یاد بگیرد تا برای شکست دادن ناین در زمین نبرد، بخشی از کنترل را واگذار کند. اولین قدم چیست؟ اینکه اجازه بدهند تیم کنترل کامل را به دست بگیرد.
سونیک به «هیچ کجا» می شتابد تا دزدان دریایی را پیش از آنکه دنیایشان نابود شود نجات دهد. اما ناین هنوز به انرژی سونیک برای قدرت دادن به پارادوکس پریزم نیاز دارد.
سونیک برای کمک گرفتن در نبرد علیه ناین و نوچه های بالدارش، راهی نیویوک می شود و با افرادی که هیچ انتظارش را نداشت اتحاد برقرار می کند.
ناین که پارادکس پریزن را در دست دارد، شروع به تبدیل کردن گریم به بهشت شخصی خود می کند؛ مگر آنکه سونیک و شدو بتوانند متقاعدش کنند این کار را نکند.
